一、認定條件不同
1.從事貨物生產或者提供應稅勞務的納稅人，以及以從事貨物生產或者提供應稅勞務為主，并兼營貨物批發或者零售的納稅人，年應征增值稅銷售額（以下簡稱應稅銷售額）在50萬元(含)以下的，為小規模納稅人；超過該標準即為一般納稅人。
2.對上述規定以外的納稅人，年應稅銷售額在80萬元(含)以下的，為小規模納稅人；反之，超過該標準即為一般納稅人。
二、帳務處理不同
(一)在購買商品時，如果對方開具增值稅發票，兩者處理存在不同
1、一般納稅人處理為
借 庫存商品等
借 應交稅費-應交增值稅(進項稅額)
貸 銀行存款等
2、小規模納稅人為
借 庫存商品等
貸 銀行存款等
小規模納稅人不能抵扣進項稅
(二)在銷售商品時，采用的稅率不同
1、一般納稅人：
借：銀行存款(或應收賬款)
貸：主營業務收入
貸：應交稅費--應交增值稅(銷項稅額)
2、小規模納稅人：
借：銀行存款(或應收賬款)
貸：主營業務收入
貸：應交稅費--應交增值稅
三、稅收管理規定不同
1、一般納稅人：銷售貨物或提供應稅勞務可以開具增值稅專用發票；購進貨物或應稅勞務可以作為當期進項稅抵扣；計算方法為銷項-進項。
2、小規模納稅人：只能使用普通發票；購進貨物或應稅勞務即使取得了增值稅專用發票也不能抵扣；計算方法為銷售額×征收率。
四、稅率與征收率不同
1、一般納稅人：16%，10%，6%，0稅率。
2、小規模納稅人：3%，2%，5%。